A Emmanuel College, segue no processo de ensino-aprendizagem o currículo vigente no Sistema Nacional de Educação proposto pelo MINEDH.
O Ensino Secundário compreende cinco classes, subdivididas em dois (2) ciclos:
- 1º Ciclo, de 8ª a 10ª classe;
- 2º Ciclo, de 11ª a 12ª classe.
